Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cops5O35864 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops5O35864 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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