Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Timm44O35857 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Timm44O35857 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Timm44O35857 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Timm44O35857 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms