Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms