Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfibp2O35711 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms