Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2bO35690 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms