Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ptch2O35595 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ptch2O35595 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ptch2O35595 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ptch2O35595 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptch2O35595 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms