Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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