Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms