Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms