Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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