Protein–RNA interactions for Protein: O35127

Grcc10, Protein C10, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grcc10O35127 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Grcc10O35127 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Grcc10O35127 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms