Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PbsnO08976 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PbsnO08976 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms