Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms