Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltaO08585 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltaO08585 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltaO08585 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltaO08585 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltaO08585 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltaO08585 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltaO08585 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CltaO08585 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltaO08585 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltaO08585 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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