Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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