Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm3239L7N2D9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm3239L7N2D9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm3239L7N2D9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm3239L7N2D9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm3239L7N2D9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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