Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Rfpl4-201ENSMUST00000045215 1598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Cfap77-202ENSMUST00000157048 1042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Cyb5d2-203ENSMUST00000156294 2158 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms