Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm21976J3QNN2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Gm21976J3QNN2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gm21976J3QNN2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gm21976J3QNN2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gm21976J3QNN2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm21976J3QNN2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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