Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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