Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms