Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20828J3KMI7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms