Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms