Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms