Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms