Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r67G5E8C1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r67G5E8C1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms