Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms