Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms