Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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