Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms