Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5160F8VPN3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5160F8VPN3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5160F8VPN3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms