Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms