Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms