Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms