Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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