Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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