Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrdnE9Q9K5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrdnE9Q9K5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms