Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms