Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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