Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r238E9Q373 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r238E9Q373 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r238E9Q373 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r238E9Q373 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms