Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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