Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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