Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms