Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ddx60E9PZQ1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ddx60E9PZQ1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ddx60E9PZQ1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ddx60E9PZQ1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ddx60E9PZQ1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ddx60E9PZQ1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms