Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms