Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gimd1E9PW74 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms