Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms