Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms