Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms