Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9630041A04RikD3Z3U4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms