Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms